生殖器疱疹主要是由单纯疱疹病毒(HSV)Ⅱ型引起的一种性传播疾病，病毒可沿周围感觉神经纤维进入感觉神经或自主神经节潜伏下来，一旦有诱因刺激，如感染、月经期、受寒、免疫抑制，可出现生殖器疱疹复发。此病初发症状较重，易复发，孕妇感染后可引起流产和新生儿感染，还可能与宫颈癌的发病有关。
生殖器疱疹治疗后反复发作的现象在临床上比较常见，而复发的因素通常和以下几点有关：
一、未按疗程用药或自行盲目治疗：有的患者在治疗生殖器疱疹的过程中，存在轻视和急躁的心理，没有按疗程用药，见症状稍有好转就停止治疗，这样就会为日后的复发埋下隐患。还有些患者则是自己乱买药、乱用药，这会导致耐药性的发生，对身体也有毒副作用，也可造成生殖器疱疹的反复难愈。
二、治疗方法不当，治标却不治本：采用传统的抗病毒类药物或化学方法医治生殖器疱疹只是治标，不能治本，使用抗干扰素等被动方法只能抑制病毒复制，不能清除掉存在于血液组织细胞核中的病毒。另外，抗生素的滥用影响机体的免疫性能，制约和影响着疾病的治疗过程，同样是治标不治本的方法。总而言之，这些不当的治疗方法都会促使生殖器疱疹的复发。
三、不注意卫生，再次被病毒感染：如果平时不注意个人卫生，没有对自己接触过的沾有病菌的衣裤、日用品进行消毒处理，性伴侣没有及时检查和治疗等，这些因素的存在很容易导致患者治疗后再次被感染上，进而就会引起复发。
四、人体太弱也会导致复发：经过综合治疗使得疱疹消退后，损伤处修复如初。但是少数残余的病毒可发生变异，隐藏于神经细胞内。当患者下降时，潜伏的病毒重新复活，开始繁殖，然后大量复制出新病毒，又沿神经轴返回皮肤黏膜，引起新的疱疹，病灶可逐渐扩大，从而出现疱疹复发。酗酒、吸烟、过劳、睡眠不足、缺乏锻炼等因素都会降低。
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